Наименьшая оптовая цена
(без НДС  )
Оптовая партия (ед.) Розничная цена
(без НДС  )
Срок поставки
по запросу   по запросу под заказ

Секвенатор NGS Ion Torrent GeneStudio S5 Plus, Thermo Fisher Scientific

Секвенатор NGS Ion Torrent GeneStudio S5 Plus, Thermo Fisher Scientific

Секвенирующая система Ion GeneStudio S5 Plus - это прибор для секвенирования нуклеиновых кислот нового поколения (NGS) на основе полупроводниковой технологии для обеспечения процессов определения нуклеотидов. От SNP (точковых мутаций, полиморфизмов генов) до крупных проектов таких как рассмотрение экзома система Ion GeneStudio S5 Plus способна обеспечить гибкость, помочь лабораториям в управлении проектами различных размеров в нескольких приложениях.

Реагенты собраны в картриджах, система дружественна пользователю, приспосабливается к требованиям лаборанта.

В приборе используются микросхемы Ion 5 Series, которые можно применить для высокопроизводительного секвенирования в широком диапазоне размеров анализируемого фрагмента. Секвенатор применим как для клинических исследований, так и для исследовательских, от анализа геномов плазмид и микроорганизмов, до широких спектров генных кастомных панелей, от точковых замен до полноценных экзомов и транскриптомов.
Все приборы серии Ion GeneStudio S5 построены на полупроводниковой технологии и используют архитектуру жидкой части во всех трех моделях: система Ion GeneStudio S5, система Ion GeneStudio S5 Plus и система Ion GeneStudio S5 Prime. Основное различие между этими тремя инструментами - время анализа на секвенсоре

Особенности и преимущества:

Вы сможете выбрать микросхему (Ion 510–550), которая нужна для вашего приложения и согласуется с пропускной способностью от 2 до 130 миллионов операций чтения за запуск.

Реагенты plug-and-play на основе картриджей сокращают время настройки и сложность процедур.

Цикл исследования и анализ результата занимает меньше времени, и Вы можете двигаться согласно алгоритмам института, вписываясь в систему отчетов с экспериментами.
Серия Ion GeneStudio S5 в сочетании с системой Ion Chef позволяет перейти от библиотеки ДНК к анализу данных всего за 24 часа с 45 минутами общего рабочего времени, 10 часов – на чипе Ion 540, 11,5 часов чипе Ion 550.

Технология Ion AmpliSeq для выбора мишени, система Ion Chef для автоматической подготовки библиотек, наличие алгоритмов и шаблонов в программном обеспечении Ion Reporter для автоматической аннотации вариантов целевого секвенирования упрощают процесс исследования.

Прибор с технологией Ion AmpliSeq и серией Ion GeneStudio S5 позволяет провести изучение при небольшом количестве ДНК и РНК (1 нг) из сложных образцов (FFPE ткани, ретроспективные образцы из тонкоигольных аспиратов, внеклеточная ДНК из крови).

Масштабируемость

Чипы Ion 5 Series, предназначенные для Ion GeneStudio S5 Series, имеют несколько вариантов пропускной способности. Лаборатория будет способна гибко подстраиваться к величине проектов, используя целевые приложения для секвенирования на платформе. Можно одномоментно отсеквенировать за запуск от 1 до 384 образца. Совместимость с чипами Ion 510, Ion 520, Ion 530, Ion 540, Ion 550. Максимальная пропускная способность 30 G (2 чипа Ion 540).

Вы можете использовать как простое программное обеспечение Torrent Suite для новичков, так и программное обеспечение Ion Reporter для экспертов NGS. ПО Torrent Suite, предварительно установленное на сервере Torrent, позволяет планировать, отслеживать и анализировать прочтения генетического кода, провести аннотацию, вторичный анализ данных. ПО Ion Reporter, установленное на Thermo Fisher Cloud или местные его аналоги, позволяет интегрировать, комментировать и интерпретировать варианты прочтения. Для резервного копирования и хранения данных предлагается использовать DataSafe. С его помощью можно спланировать также дизайн эксперимента и вести лабораторный журнал.
Всесторонняя техническая поддержка и консультации обеспечиваются специалистами и аттестованными инженерами Thermo Fisher Scientific по всему миру. 

Как подобрать чип под ваши задачи?

Необходимо соотнести размер анализируемых фрагментов, количество и вид образцов с выводом данных, оптимизируя под ваше приложение.

Так, максимальная производительность (прочтения) Ion 510 составляет 3 млн прочтений (200 п.н. 0.3–0.5 Gb или 400 п.н. 0.6–1 Gb), Ion 520 – 6 млн прочтений (200 п.н. 0.6–1 Gb, 400 п.н. 1.2–2 Gb, 600 п.н. 0.5–1.5 Gb), Ion 530 – 20> (200 п.н. 3–4 Gb, 600 п.н. 1.5–4.5 Gb), Ion 540– 80 (200 п.н. 10–15 Gb), Ion 550 – 130 (200 п.н. 20–25 Gb, всего 20 – 25 млрд. п.н..

Если вам нужно провести таргетное секвенирование ДНК, применим универсальный Ion Torrent™ Oncomine™ Focus Assay, подойдет любой из чипов и зависит его выбор только от того, сколько данных вы планируете получить.

Под секвенирование малых геномов, например, типирование бактерий, с задачей изучения от 3 до 6 млн прочтений подойдет тип чипаIonXpress™PlusFragmentLibraryKit и, следовательно, чип Ion510 или Ion520.

Для метагеномного секвенирования 16S рРНК (метагеномика) с задачей изучения от 3 до 6 млн прочтений можно применить Ion 16S™ Metagenomics Kit и, следовательно, чип Ion510 или Ion520.

Для секвенирования экзома 80-130 млн прочтений используют в основном тип чипа Ion AmpliSeq™ Exome Panel – это будет Ion540,Ion550.

Для таргетного секвенирования РНК чип подбирают в зависимости от размера фрагментов и анализируемых данных, с типом чипа IonAmpliSeq™made-to-orderRNApanels или аналогичным.

Профилирование микро/малых РНК от 3 до 20 млн прочтений тип чипа Ion Total RNA-Seq v2 Kit - и, следовательно, чип Ion510 или Ion520.

Таргетное секвенирование транскриптома Ion AmpliSeq™ Transcriptome Human Gene Expression Kit – от 80 до 130 прочтений – это будет Ion540, Ion550.

Секвенирование полного транскриптома Ion Total RNA-Seq v2 Kit - от 80 до 130 п.о. – это будет Ion540, Ion550.

Преимплантационный генетический скрининг – тип чипа Ion ReproSeq™ PGS Kit чип Ion510,Ion520, чип Ion530. 

Вы можете купить Секвенатор NGS Ion Torrent GeneStudio S5 Plus, Thermo Fisher Scientific в Москве в нашей компании по наименьшей цене.